IMAgenGINE弥散灌注后处理软件Beta2.0发布(包括组学及云计算功能)

 

一 增加登录功能

 

感谢腾讯云提供的代金券,我们搭建了一台云服务器可以用来支持科研。一些很难部署在您电脑上的新方法:譬如AI等未来都可以逐渐部署在这台服务器上了。我们这次部署了一个放射组学特征计算作为初步的尝试,今后你下载的这个弥散灌注后处理工具渐渐将向一个客户端转化。

因此,您需要申请一个新的用户名密码才能使用这个软件。首先访问www.vusionmed.com注册,注册后请务必至注册邮箱接受一个附带激活链接的邮件激活(请检查垃圾邮件。)再通过以下两种方式联系我们开通就好了:

  1. 直接在网站www.vusion.com.cn的Support页留言

  2. 发信至customer@vusion.com.cn

你需要简单描述您的使用目的和所在单位(热烈欢迎各影像设备厂商Clinical Scientists),我们很快会为您人工开通。开通后,只需要登录一次,以后都可以脱机使用了(组学特征计算等需要连接服务器的功能还需要登录使用)。

二 数据IO

 

我们加入了西门子磁共振DICOM的支持(Mosaic图像也可以用于计算)。并且解决了之前对于飞利浦enhanced DICOM数据的一些BUG。现在应该可以比较好的兼容GPS三家的数据。

 
 
 

三 全新的ROI绘制

 

最开始设计这个处理工具的初衷是仅仅提供计算功能,然后用户再使用别的工具进行测量统计,因此在ROI绘制这方面就没有进行仔细的开发。结果很多用户还是更习惯于直接在处理工具上测量,我们就重做了这一部分。

 

新版本的ROI绘制机制参照了3DSlicer,改用了Label Map来标记不同的ROI。提供了轮廓框选(快捷键o)以及笔刷涂抹(快捷键p)两种绘制方式,并加入了撤销/重做以及保存/读入的功能。ROI的简单统计结果也可以导出为.csv文件了。

ROI的Label Map和原始图像均使用物理坐标系并严格对应。

 

另外新版本的ROI模块加入了第一个基于区域生长法的半自动功能,您只需要在块状(如肿瘤)的内部使用ROI1随便刷一下,再在其外侧的上下左右前后六个方向使用ROI9标记。即可使用半自动功能自动生成三维的初始标注了。

 

新版本ROI更新功能较多,我们做了一个视频简单展示:

 
 
 

四 放射组学特征计算

 

登陆情况下,绘制好感兴趣的ROI,就可以使用软件上方的 按钮进行计算了。计算需要上传感兴趣区的数据给服务器, 我们不会收集DICOM或被试信息。因为首先我们不想接触敏感信息,其次DICOM文件过大,我们负担不起足够计算能力和带宽的服务器。不过您的ROI标注我们有可能用于训练自动分割的神经网络。

服务器处理完毕后,会以.csv的格式发回到软件根目录的tmp文件夹下。您可以直接用excel等软件打开,也可以访问我们的服务器,登录后查看计算结果。

 
同时我们正向CS架构过渡,将通过搭建Docker微服务以上线更多更前沿的影像处理工具。